Después de haber superado las crisis provocadas por Gnasty Gnorc y Ripto, las coasa parecen ir bien para los dragones. Pero solamente lo parecen. En medio de tanta paz, una bruja mala (hay pocas brujas buenas) llega para sembrar el caos.
En su momento más duro, Spyro tendrá que unirse a nuevos amigos y recuperar los huevos de de dragón perdidos durante el ataque inesperado.