Las misiones N7 son un conjunto de misiones (6 en total) que te irán proporcionando paulatinamente durante el juego al ir superando las fases del modo principal. Siempre te las dará Traynor, por lo que será difícil que pierdas la posibilidad de conseguir alguna.
Al superarlas te darán recursos bélicos, dinero, reputación y, casi más importante, a lo largo de estas misiones encontrarás objetos que te servirán para resolver otras misiones de la Ciudadela, así que estate atento cuando realices estas misiones para no pasar por alto estos objetos.