Las misiones cooperativas de Assassin’s Creed Unity permiten que juguemos con hasta tres otros jugadores para llevar a cabo partes de la historia que no tienen que ver con la aventura de Arno, pero sí con la lucha de los asesinos y los templarios en el contexto del París revolucionario.
Estas misiones pueden jugarse directamente desde el menú de mapa, tanto en solitario (privado) como con otros jugadores a través de Internet, y como gran atractivo tienen puntos de sincronización como recompensa de finalización, además de otros puntos de sincronización complementario que podemos encontrar en las propias misiones.