The Legend of Zelda: Tri Force Heroes no contará con soporte para dos jugadores en su modo de historia. Se podrá jugar en solitario o en trío, pero no en parejas.
Si el jugador apuesta por superar el modo historia en solitario, deberá ir cambiando su control entre los tres personajes diferentes. Los otros dos quedarán estáticos mientras tanto.
Hiromasa Shikata, director del juego, ha confirmado que "no puedes jugar los escenarios normales con dos personas. Si alguien deja la partida, saldrá una pantalla de fin de juego". Eso sí, el título salvará el progreso hasta ese momento concreto y la partida se puede retomar tras sumar un tercer jugador o bien pasando al modo solitario.
Además, en su apuesta por el multijugador, el modo competitivo sí permitirá de dos a tres jugadores.