| Trofeos | Requisitos |
| Bronce | |
| Avalanche (10) | Vence a un enemigo como una bola de nieve. |
| Bear With Me (10) | Vence a 10 enemigos como el oso. |
| Big Guy (10) | Vence a un enemigo de grandes dimensiones. |
| Boardom (10) | Vence a 10 enemigos como el jabalí. |
| Bow Before Me (20) | Vence a 50 enemigos con el arco. |
| Don't Blame it on the Sunshine (10) | Lleva la luz a los ciudadanos del cementerio. |
| Eat My Dust (10) | Viaja lejos a pleno galope. |
| Found Futo (10) | Encuentra a Futo. |
| Found Kunoichi (10) | Encuentra y libera a Kunoichi. |
| Found Shun (10) | Encuentra y libera a Shun. |
| Found Suzume (10) | Encuentra y libera a Suzume. |
| Found Tora (10) | Encuentra y libera a Tora. |
| No Conjurer of Cheap Tricks (20) | Gasta 1500 Ki usando magia Kuji. |
| Off The Richter Scale (30) | Vence al jefe Lumbering Fool. |
| Off You Go (20) | Completa el entrenamiento básico. |
| Pied Piper (10) | Incita a 50 enemigos a bailar. |
| Poker (10) | Vence a 30 lanceros con la lanza. |
| Sightseeing (30) | Visita todos los templos. |
| Smell You Later (30) | Vence al jefe Windy Pants. |
| Smooth Sailing (10) | Navega sin recibir daño por el río del Gran Cañón. |
| Tree Hugger (10) | Agita 15 árboles. |
| Plata | |
| Botanist (30) | Colecciona un ingrediente de cada. |
| Crash landing (30) | Vence al jefe Screeching Owl. |
| Lost and Found (20) | Recupera los cinco ninjas perdidos. |
| Now You See Me ... (40) | Vence a 100 enemigos con ataques sigilosos. |
| Restore Balance (40) | Vence al malvado Señor de la Guerra Samurai. |
| Sage of Philosophy (50) | Alcanza el tope de tu nivel. |
| Stop! Futo Time! (20) | Usa a Futo en combate en todos los niveles. |
| Tengu Friend (40) | Completa todas las misiones del Caminante Tengu. |
| Tripped and fell (30) | Vence al jefe Timid Swimmer. |
| Oro | |
| Animal Friend (100) | Libera todos los animales enjaulados. |
| Completist (100) | Recoge todas las estatuas Jizo. |
| Hard Little Ninja (100) | Completa el juego en modo difícil. |
| Little Ninja (50) | Completa el juego en modo normal o fácil. |
| Silent Assas... Ninja (50) | Completa un nivel sin ser visto. |
| Platino | |
| Platinum Trophy | Consigue todos los trofeos del juego. |
