Los jugadores de Fire Emblem: Three Houses tendrán la libertad de escoger la orientación sexual de su personaje: el usuario podrá tener relaciones sentimentales con personajes de su mismo sexo.
Por ahora no se ha confirmado cómo se integrarán las relaciones sentimentales ni el impacto que pueden tener.
Tampoco sabemos si esta será una característica que se vaya a censurar en alguna de las regiones.
Puesto que la confirmación de este tipo de relaciones llega desde Nintendo América podemos asumir que la versión occidental del juego y la japonesa serán iguales en este sentido.