The Surge cuenta principalmente con dos finales diferentes que se van a dibujar en función de lo que hagamos en nuestros pasos finales en el enfrentamiento contra el jefe. Las escenas escenas que descubriremos una vez pasado el jefe no serán muy diferentes en estructura, pero sí en su resultado.
En el primer final nos enfrentaremos directamente al jefe sin cargar el virus en la consola y desbloqueamos el logro/trofeo "Un mundo feliz"; si decidimos utilizar el terminal, conseguiremos el segundo final y obtendremos el logro "Por el bien de la humanidad".
Los dos trofeos son excluyentes: no se pueden conseguir a la vez.