Ken Rosman, productor ejecutivo de Prototype 2, ha dicho que Activision no descarta hacer un juego de acción en primera persona de Prototype, o un título de cualquier otro género, dado que la saga no está necesariamente vinculada a un género o una situación; ni a un personaje, como demuestra el cambio de protagonista en esta segunda parte.
En declaraciones a la Revista Oficial Xbox del Reino Unido, que recoge la web CVG, Rosman explica que "si no vinculamos la saga a un solo personaje, entonces eso significa que no estamos vinculados a un lugar particular tampoco", significando que en alguna futura entrega la saga podría abandonar la ciudad de Nueva York como escenario. Rosman dice que la clave de la saga es el virus que convierte a los humanos en mutantes superpoderosos, lo que les permite "soltarlo en cualquier situacion y ver a dónde les lleva".
Rosman continúa comentando que "incluso podríamos ver Prototype en diferentes géneros; podría aparecer como un juego de acción en primera persona, con un equipo militar operando en la jungla, quizás". Concluye diciendo que "hemos tomado la decisión de hacer de Prototype 2 una continuación directa del original, pero el virus abre muchas posibilidades en el futuro...".
En desarrollo para PlayStation 3, Xbox 360 y PC, Prototype llegará a las tiendas en 2012.