Nintendo ha mostrado en su sección "Iwata Pregunta" el concepto original con el que empezó a trabajar en Paper Mario para Nintendo 64, el cual mantiene la esencia pero difiere visualmente de juego que conocemos hoy en día y que ha llevado a varias plataformas de Nintendo.
En concreto, esta imagen fue creada por Naohiko Aoyama, responsable del diseño de juego, y ya mezcla escenarios poligonales con personajes bidimensionales, tal y como podéis ver, extraídos de Super Mario World.
Cuando "Mario RPG 64", como iba a llamarse, entró en desarrollo ya empezó a tomar la estética de papel que vemos hoy en día, aunque desde su origen la historia iba a desarrollarse apostando por el look de "libro infantil trasladado a videojuego".