| Trofeos | Requisitos |
| Alpha Protocol (Plata) | Completa la operación Desert Spear. |
| Antisocial (Bronce) | Consigue que 3 personas te odien. |
| Ask Questions First, Shoot Later (Bronce) | Abstente de matar a sangre fría. |
| Assault Rifle Marksmanship (Bronce) | Consigue 100 disparos en la cabeza con el Rifle de Asalto. |
| Basic Training (Bronce) | Completa la misión de entrenamiento. |
| Black Belt (Bronce) | Vence a 50 enemigos con CQC. |
| Breaking and Entering (Bronce) | Rompe 10 cerraduras. |
| Building a Deadlier Mousetrap (Bronce) | Consigue situar y detonar 100 artilugios. |
| Circuit Breaker (Bronce) | Deriva 20 artilugios electrónicos. |
| Data Theft (Bronce) | Hackea 10 ordenadores. |
| Desert Spear (Bronce) | Asesina a Sheikh Shaheed. |
| Evolution of an Action Hero (Plata) | Completa el Protocolo Alpha usando el fondo Recluta. |
| Full Circle (Oro) | Completa el juego. |
| Hard to Read (Bronce) | Usa cada opinión al menos un 25% en 90 elecciones de opinión en diálogos diferentes. |
| Hardcore (Oro) | Completa el juego en modo difícil. |
| Judge, Jury, and Executioner (Bronce) | Haz que tu arma lleve la conversación. |
| Ladies' Man (Bronce) | En una sola carrera, mantén un romance con todas las mujeres del juego. |
| Lurker (Bronce) | Evade o mata a 75 enemigos en tu carrera. |
| No Time For Love (Bronce) | Completa el juego sin ser seducido. |
| One With The Shadows (Bronce) | Completa 3 misiones con menos de 5 muertes y sin que ningún enemigo se dé cuenta de tu presencia. |
| Operation Blood Feud (Plata) | Completa la operación Blood Feud. |
| Operation Deus Vult (Plata) | Completa la operación Deus Vult. |
| Operation True Heirs (Plata) | Completa la operación True Heirs. |
| Pistol Mastery (Bronce) | Consigue 100 tiros críticos con la pistola. |
| Platinum (Platino) | Consigue todos los trofeos del juego. |
| Ready For Anything (Bronce) | Consigue la mayoría de documentos del juego. |
| Shotgun Crowd Control (Bronce) | Consigue 100 tiros críticos con la escopeta. |
| SMG Havoc (Bronce) | Consigue el máximo multiplicador de golpe crítico con la SMG 7 veces en una carrera. |
| Social Butterfly (Bronce) | Consigue gustar a 3 personas a la vez. |
| Technophile (Bronce) | Completa 5 misiones en las que se utilicen 6 artilugios. |
| Thorton, Inc. (Plata) | Convierte a todos tus enemigos en aliados en una carrera. |
