Team Ninja está interesada en colaborar con Nintendo una vez más para desarrollar un juego de Metroid tras Metroid: Other M.
Yosuke Hayashi, director de Dead or Alive 5, ha respondido sobre una hipotética secuela que "desgraciadamente, Metroid está fuera de nuestras manos y es un juego de Nintendo, pero estamos en contacto con el co-creador Yoshio Sakamoto, queremos hacer algo con él. Todo depende de lo que él quiera hacer con el juego".
Metroid: Other M se lanzó en 2010 en Wii, causando división de opiniones entre los jugadores.