Satoru Iwata, presidente de Nintendo, y Shigeru Miyamoto, padre de la saga, han confirmado que The Legend of Zelda: Ocarina of Time 3D tendrá nuevos contenidos que no estaban en el original de Nintendo 64.
Esta revisión del título para Nintendo 3DS ofrece gráficos íntegramente poligonales (el original contaba con fondos prerrenderizados en algunas localizaciones), novedades en el control para aprovechar las 3D y la detección de movimientos de la consola, y la versión Master Quest del juego. Esa versión se preparó para el 64DD, el accesorio de discos ópticos para Nintendo 64 que solo salió a la venta en Japón, pero el título no se comercializó jamás. Incluía nuevos puzles, localizaciones alternativas de objetos, enemigos más difíciles, etc. No vio la luz hasta 2003, cuando se ofreció como disco especial junto a Wind Waker, en GameCube.
Sin embargo, ahora ejecutivo y creativo comentan que "por supuesto, la versión para Nintendo 3DS de Ocarina of Time está llena de cosas interesantes que no estaban en la versión de Nintendo 64. Pero tendremos que esperar para poder hablar sobre eso."
