Nintendo y Chunsoft han anunciado que Pokémon Mundo Misterioso 2 llegará al mercado en dos versiones distintas, aunque a diferencia del original, en esta ocasión las dos serán para Nintendo DS, al contrario que en el primer capítulo de la serie en el que uno de los juegos estaba destinado a Game Boy Advance.
Por tanto, cada una de las dos versiones del juego contará con distintos equipos de combate a manejar, así como diversas mazmorras y objetos que en la versión contraria no se podrán conseguir. Se espera que Pokémon Mundo Misterioso 2 llegue a las tiendas japonesas a finales del presente ańo.
